税收是国家财政收入的主要来源，是国家发展公益事业，促进经济和社会全面发展及实现国家管理职能的基本保证。一切经济组织和公民都有依法纳税的义务。个人独资企业从事经营活动应当依法履行纳税义务。
关于个人独资企业及其投资人的所得税负担问题，在制定个人独资企业法的过程中始终是各方关注的焦点问题之一。按照现行企业所得税暂行条例的规定，个人独资企业应当根据其应税所得额缴纳33％的企业所得税。同时，按照个人所得税法的规定，个人独资企业的投资人从企业分得的利润还要缴纳20％的个人所得税。本办法生效后，将有部分具备条件的个体工商户转为个人独资企业，而他们过去只按应税所得额5—35％的超额累计税率缴纳个人所得税，转为个人独资企业后，要缴纳二道税，将加重他们的税负。对此，许多全国人大常务委员会委员在审议个人独资企业法（草案）时提出，对个人独资企业应当只收一道税，避免双重征税。经研究，全国人大法律委员会认为，对个人独资企业如何征税问题情况比较复杂，涉及我国现行税收制度的调整和完善，需要在制定税法时通盘考虑。因此，只对个人独资企业依法履行纳税义务作了规定。目前，国家有关部门已经注意到双重征税对个人独资企业发展的影响，正在着手研究解决这一问题。但在问题解决之前，个人独资企业仍应依法履行纳税义务。
